L’analyse intégrée du profil génétique et métabolique suggère un métabolisme altéré de la phosphatidylcholine dans l’asthme. : Ried JS, Baurecht H, Stückler F, Krumsiek J, Gieger C, Heinrich J, Kabesch M, Prehn C, Peters A, Rodriguez E, Schulz H, Strauch K, Suhre K, Wang-Sattler R, Wichmann H-E, Theis FJ, Illig T, Adamski J, Weidinger S.
Integrative genetic and metabolite profiling analysis suggests altered phosphatidylcholine metabolism in asthma.
dans Allergy 2013 ; 68:629−636
– Contexte :
- Les études d’association au génome ont identifié beaucoup de loci à risque pour l’asthme, mais la taille de l’effet est faible, et dans la plupart des cas les mécanismes biologiques restent incertains
- La quantification ciblée des métabolites fournit une information sur un large éventail de voies métaboliques d’intervention qui peut aider à identifier des bio-marqueurs et à explorer les mécanismes de la maladie
- La combinaison d’une information génétique et métabolique peut aider à caractériser les signaux génétiques associés avec une résolution élevée.
– Objectif :
- L’objectif de ce travail était d’étudier les relations entre l’asthme courant, les allèles candidats à un risque élevé d’asthme, et un panel de métabolites.
– Méthodes :
- Les auteurs ont étudié 51 métabolites, qui ont été quantifiés par spectrométrie de masse, à partir de sérums prélevés à jeun de sujets asthmatiques et non asthmatiques provenant de l’étude de population KORA F4 (n=2925)
- De plus ont été analysés les effets des polymorphismes d’un nucléotide unique sur ces métabolites, au niveau de 24 loci à risque d’asthme.
– Résultats :
- Des taux augmentés de diverses phosphatidylcholines et des taux abaissés de diverses lyso-phosphatidylcholines étaient associés à l’asthme
- Par ailleurs, les allèles à risque d’asthme des gènes PSMD3 et MED24, au locus 17q21 de susceptibilité d’asthme, étaient associés à des concentrations augmentées de diverses phosphatidylcholines, avec des effets directionnels consistants.
– Conclusions :
- Cette étude montre le potentiel de certains métabolites à devenir des biomarqueurs liés à l’asthme, par le biais de l’identification de phospholipides dérégulés qui sont associés à l’asthme et à des allèles de risque pour l’asthme.