Les allergènes polliniques sont limités à quelques familles de protéines et montrent des profils distincts de distribution d’espèces. : Christian Radauer, PhD, Heimo Breiteneder, PhD
From the Department of Pathophysiology, Center of Physiology and Pathophysiology, Medical University of Vienna
dans JACI Volume 117, Issue 1, Pages 141-147 (January 2006)
– Contexte :
- Les allergies respiratoires sont essentiellement causées par des pollens de plusieurs espèces de plantes.
- Cependant une classification du grand nombre d’allergènes polliniques identifiés fait toujours défaut.
– Objectif :
- Analyser les séquences d’allergènes polliniques en respectant leur affiliation aux familles de protéines, la répartition taxonomique des familles de protéines et leur variabilité inter espèces.
– Méthodes :
- L’appartenance aux familles de protéines de toutes les séquences d’allergènes de plantes de la base de donnée d’Allergome a été déterminée par l’utilisation de la base de données des familles de protéines par la méthode "Hidden Markov Models".
- La distribution taxonomique des allergènes polliniques a été établie à partir du système d’information de taxonomie intégrée (ITIS).
- Les membres des familles contenant de nombreux allergènes polliniques ont été comparés à des homologues allergéniques et non allergéniques par recherche des similarités et par alignements multiples de séquence.
– Résultats :
- Les allergènes polliniques ont été classés dans 29 des 7868 familles de protéines.
- Expansines, profilines et protéines liées au calcium constituent les familles majeures d’allergènes polliniques, tandis que la plupart des allergènes alimentaires appartiennent aux prolamines, cupines et aux profilines.
- Les allergènes peuvent être :
- ubiquitaires comme les profilines.
- présents dans certaines familles de plantes comme les pectate lyases.
- limités à un seul taxon comme les protéines thaumatin-like.
- Les profilines allergéniques des plantes constituent une famille hautement conservée avec des identités de séquence de 70 à 85% les uns par rapport aux autres mais des identités de séquence faibles avec les profilines non allergéniques des autres eucaryotes, incluant les humains.
- De façon similaire, les polcalcines allergéniques possèdent des identités de séquence de 64 à 92% mais montrent de faibles identités de séquence avec les calmodulines non allergéniques apparentées et les protéines calmodulin-like des tissus végétatifs des plantes et de l’homme.
– Conclusion :
- Cette classification des allergènes polliniques dans des familles de protéines nous aidera à prédire les réactivités croisées, à concevoir des moyens diagnostiques complets et à évaluer le potentiel allergénique de nouvelles protéines.
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